真核生物mRNA測序的研究對象為特定細胞或組織在某一功能狀態下轉錄出來的mRNA集合，通過oligo-dT磁珠捕獲帶polyA尾的RNA進行建庫測序，也稱為PolyA-Seq?？裳芯?/span>mRNA差異表達或檢測結構變異，篩選與疾病或性狀相關的分子標記；還可揭示轉錄組的復雜性，確定基因以及轉錄本結構、可變剪接、RNA編輯、帶polyA尾的非編碼RNA 和新轉錄本。目前已廣泛應用于基礎研究、分子育種、臨床診斷和藥物研發等領域。

技術路線

樣品要求

        樣品類型：細胞、新鮮組織或完整性良好的Total RNA樣品。

        物種：真核生物（詳詢技術支持）

        具體樣品量要求及樣本采集、保存和運輸方法請參照附錄一。

測序方案

        測序模式 PE150

        測序數據量 5Gb 

生物信息分析內容

        1 原始數據質控檢查

        2 比對結果質控檢查

        3 基于基因表達的樣品主成分分析

        4 差異基因表達分析

        5 差異基因GO功能分析

        6 差異基因通路分析

        7 變異剪切分析 （40M pair end reads）

        8 基因突變分析（40M pair end reads）

        9 轉錄調控活性分析及通路互作分析

吉賽生物NGS樣本采集、保存、運輸要求（2020年version2.2）